Сюжет данной игры несколько отличается от событий в аниме. Начнем с того, что Кира знает о существовании всех подгруппировок Эла, соответсвенно и его самого. Лично они тоже знакомы, встречались в штабе.
Эл знает о существовании Мисы Амане как о подружке Лайта, которая тоже является подозревемой.
Миса наслышана об Эле, но лично с ним не знакома. Сейчас она выполняет обязанности Киры, в то время как Лайт пытается ближе подобраться к Элу.
Миками Теру лично знаком с Кирой и его способностями. Об Эле он также наслышан, но с ним как таковым не встречался.
Мелло изначально, будучи уже независимым от Вамми-хауза, находится в своем убежище и ведет свое собственное расследование.
Ниар состоит во главе СПК и также сродни Мелло ведет свое расследование. И Ниар и Мелло естественно связаны с Эло